Grâce aux performances des techniques de séquençage actuelles, plusieurs génomes ont pu être séquencés par espèce. Il semble universel, de la bactérie à l’homme, que le génome d’une espèce soit constitué d’un génome de base (core) commun à tous les individus, souches, variétés, races, et un génome dit dispersé ou distribué (dispensable) présent dans un ou plusieurs individus seulement.
Cette découverte qui était un concept il y a une dizaine d’années est maintenant source de nombreuses interrogations et de promesses : comment ont évolué ces génomes ? Quel a été l’impact de l’adaptation au milieu ? de la sélection ? Quel réservoir de gènes sont à notre disposition pour améliorer les performances des animaux d’élevage et des espèces cultivées ? L’exploitation des génomes distribués en agriculture est prometteuse car ils représentent une variabilité largement méconnue et constituent une véritable ressource de matériel génétique à disposition. Par ailleurs, la notion de génome de base peut aussi être informative pour la biologie synthétique : il met en exergue un nombre de briques restreint pour l’élaboration d’un individu viable. Ces découvertes nous interrogent sur le concept de génome de référence et de génome de base pour une espèce donnée.
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