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N3AF-2019 (4) - Plancton, la nouvelle frontière révélée par l’expédition Tara Océans

05/12/2019
Par Flora VINCENT

N3AF-2019 (4) – Note de synthèse : Plancton, la nouvelle frontière révélée par l’expédition Tara Océans par Flora Vincent & Chris Bowler

Notes Académiques de l'Académie d'agriculture de France / Academic Notes from the French Academy of Agriculture

Présentation de la revue / Presentation of the Journal

Les Notes Académiques de l'Académie d'agriculture de France (N3AF) sont un journal d'information et de formation scientifiques. La revue, dans ses éditoriaux, articles originaux, articles d'actualité, notes de conjoncture, publications de fond, revues de la littérature, synthèses, rapports, commentaires critiques d'ouvrage, opinions étayées, textes de conférences, lettres à la rédaction, etc. donne une information actualisée ayant trait à tous les domaines couverts par les dix sections de l'Académie d'agriculture de France.
La revue est pilotée par un comité éditorial dont Hervé This est le Secrétaire éditeur. Nous vous invitons à soumettre des manuscrits à notes.academiques@academie-agriculture.fr et à inviter des collègues à publier dans cette revue. Merci de consulter les Conseils aux auteurs en suivant le lien https://www.academie-agriculture.fr/publications/les-academiciens-ecrive...

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Présentation de la Note / Current Note

Citation : Vincent F, Bowler C. 2019. Plancton : la nouvelle frontière révélée par l'expédition Tara Océans, Notes Académiques de l'Académie d'agriculture de France / Academic Notes from the French Academy of Agriculture, 2019, 4, 1-16.

Édité par : Dominique Job, directeur de recherche émérite au CNRS, membre de l'Académie d'agriculture de France.

Rapporteurs

  • Brigitte Meunier, directrice de recherche CNRS au Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines BIP2.
  • Christian Ferault, membre de l’Académie d’agriculture de France.


Résumé : L’objectif de cette Note est de présenter la diversité du plancton, telle que révélée par le projet Tara Océans, et de détailler l’approche et les méthodologies adoptées par ce projet ambitieux. Sur la base d’une partie des 40 000 échantillons prélevés dans tous les océans du monde au cours de l’expédition, l’équipe a cartographié la biodiversité d’un large éventail d’organismes planctoniques et exploré leurs interactions. Ce projet est le plus important effort de séquençage de l’ADN pour les sciences de la mer réalisé à ce jour. Les analyses moléculaires ont révélé environ 40 millions de gènes, dont la grande majorité étaient nouveaux, suggérant ainsi une biodiversité du plancton beaucoup plus large que celle connue jusqu’à présent. Ces données ont fourni à la communauté scientifique des ressources sans précédent, notamment un catalogue de plusieurs millions de nouveaux gènes qui ont transformé la manière dont nous étudions les océans et évaluons le changement climatique.

Abstract: The purpose of this Note is to present the diversity and importance of the plankton, while detailing the genetic approach and methodologies adopted by the ambitious Tara Oceans project. On the basis of a portion of the 40,000 samples collected from all the world’s oceans during the expedition, the team mapped the biodiversity of a wide range of planktonic organisms, explored their interactions, and how plankton impact and are affected by their environment. This is the largest DNA sequencing effort ever done for ocean science. Molecular analyses revealed around 40 million genes, the vast majority of which were new, thus hinting toward a much broader biodiversity of plankton than previously known. These data provided the scientific community with unprecedented resources, including a catalogue of several million new genes that had transform how we study the oceans and assess climate change.

Keywords: plankton, oceans, biodiversity, community structure, biogeography, metagenomics, Tara Oceans.
Mots clés : plancton, océans, biodiversité, structure des communautés, biogéographie, métagénomique, Tara Oceans.

Contact : Chris Bowler, Institut de Biologie de l'ENS (IBENS), Département de biologie, École normale supérieure, CNRS, INSERM, Université PSL, 75005 Paris, France, et Fédération de Recherche Global Ocean Systems Ecology and Evolution, FR2022/Tara Oceans GOSEE, 3 rue Michel-Ange, 75016 Paris, France
Correspondance : cbowler@biologie.ens.fr

Flora Vincent* est spécialisée en microbiologie et écologie marine. Ingénieure agronome diplômée d’AgroParisTech, elle a complété son doctorat à l’Institut de biologie de l’École normale supérieure dans le laboratoire de Chris Bowler. Ses travaux de thèse ont utilisé les données récoltées lors de l’expédition Tara Océans, qui l’ont conduite à embarquer sur la goélette. Elle est aujourd’hui en post-doctorat au Weizmann Institute of Science où elle poursuit ses recherches sur les interactions hôte-virus. Elle est par ailleurs co-fondatrice de l’association WAX Science, qui promeut les sciences et la mixité en science à travers le développement d’outils innovants, au ton ludique et décalé.
* Adresse actuelle : Department of Plant and Environmental Sciences, Weizmann Institute of Science, 76100 Rehovot, Israel. Email : flora.vincent@weizmann.ac.il

Chris Bowler** est directeur de recherche de classe exceptionnelle au CNRS. Il dirige le Département Ecologie et Biologie Evolutive de l'institut de Biologie de l'École normale supérieure (ENS-CNRS UMR8197 / Inserm U1024). Il y poursuit des recherches sur les plantes terrestres et les organismes photosynthétiques marins, les diatomées. Depuis 2009, il est l’un des coordinateurs scientifiques de l’expédition Tara Oceans et, depuis 2013, l’un des directeurs scientifiques de Tara Oceans Polar Circle.
Chris Bowler est membre de l’EMBO (European Molecular Biology Organization). Il a reçu le Grand Prix Scientifique de la Fondation Louis D (Institut de France) en 2015 et la Médaille d’Argent du CNRS en 2010. Il est auteur d’un très grand nombre de publications dans des revues prestigieuses, Science, Nature, PloS Biology, Cell. En 2019 il a été lauréat de l’appel d’offre "ERC Advanced grants" pour le projet DIATOMIC (European Research Council).
Chris Bowler est correspondant associé de l'Académie d'agriculture de France.