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Le microbiote des semences : diversité, assemblage et transmission

25/08/2025
Par Matthieu BARRET

Matthieu Barret. 2025. Le microbiote des semences : diversité, assemblage et transmission, Notes Académiques de l'Académie d'agriculture de France / Academic Notes from the French Academy of Agriculture (N3AF), 20(1), 2, 1-12. https://doi.org/10.58630/pubac.not.a451081.

Résumé

Les plantes vivent en association avec de vastes communautés de micro-organismes, ou microbiotes, qui contribuent à la valeur adaptative des plantes. Il est admis que la majorité des membres du microbiote est issue d’un réservoir local de diversité comme le sol. Néanmoins une multitude d’espèces microbiennes utilisent la graine comme vecteur de dispersion. Cette transmission de micro-organismes par les graines permet d’assurer un processus d’héritage d’une partie du microbiote végétal entre générations de plantes. Ce document de synthèse aborde le microbiote des graines en se focalisant sur (1) sa diversité, (2) l’origine de ses membres, (3) les processus impliqués dans son assemblage, (4) sa dynamique lors des premières étapes d’installation  des   cultures,


(5) son rôle fonctionnel et (6) son potentiel pour l'ingénierie microbienne en agriculture.

Abstract

Plants are associated with vast communities of micro-organisms, or microbiota, which contribute to their adaptive value. It is usually acknowledged that most members of the microbiota originate from a local reservoir of diversity, such as the soil. However, a multitude of microbial species use the seed as a dissemination vector. This transmission of micro-organisms via seeds ensures plant microbiota inheritance from one plant generation to the next. Here, we review seed microbiota with a particular emphasis on (1) its diversity, (2) the origin of its members, (3) the processes involved in its assembly, (4) its dynamics during the early stages of crop establishment, (5) its functional role and (6) its potential for microbial engineering in agriculture.

Mots clés
diversité, écologie des communautés, graine, installation des cultures, micro-organismes, transmission

Keywords
crop establishment, diversity, microbial ecology, micro-organisms, seed, transmission

Rubrique
Cet article a été publié dans la rubrique « Potentiel de la science pour une agriculture et une alimentation durables » des Notes académiques de l'Académie d'agriculture de France.
Edité par
Mylène Durand-Tardif, membre de l’Académie d’agriculture de France.

Rapporteurs
1. Thierry Candresse, directeur de recherche INRAE, directeur de la TGU « Biologie du Fruit et Pathologie Végétale à l’INRAE Villenave d’Ornon Bordeaux.
2. Nathalie Nesi est chargée de recherche INRAE à l’Institut de génétique, environnement et protection des plantes (Rennes).

Reçu
9 avril 2025

Accepté
5 juillet 2025

Publié
25 août 2025


Citation
Matthieu Barret. 2025. Le microbiote des semences : diversité, assemblage et transmission, Notes Académiques de l'Académie d'agriculture de France / Academic Notes from the French Academy of Agriculture (N3AF), 20(1), 2, 1-12. https://doi.org/10.58630/pubac.not.a451081.