POULET Serge

 Ce qu'il faut retenir :

   Notre connaissance de la biodiversité marine est inachevée. Elle est freinée par la dimension et la profondeur des océans, recouvrant 70 % de la surface terrestre, et par la difficulté de déployer les moyens d'exploration et d'échantillonnage dans l'ensemble des milieux. Les nouvelles méthodes métagénomiques devraient permettre une percée notable des connaissances, en particulier sur la diversité des microorganismes planctoniques, et de la flore microbienne et virale estimée à des millions d'espèces. La facilité d'analyse de l'ADN conduit à la découverte d'une extraordinaire richesse génétique dans les échantillons d'eau et de sédiments ce qui laisse entendre que ces techniques révéleront beaucoup plus d'espèces que celles décrites actuellement. La confusion entre la diversité cryptique et les espèces est toutefois trompeuse ; dans la plupart des cas, ces taxons n'ont pas été et n'ont jamais été décrits comme des espèces. Cette diversité cryptique indique la diversité génétique, une composante intra-espèce de la biodiversité, telle que décrite pour les Foraminifères. Il reste par conséquent indispensable de caractériser la biologie et l'écologie des organismes pour permettre leur description formelle en tant qu'espèce et leur rôle dans les écosystèmes. Les récentes bases de données structurées permettent des avancées sur la connaissance des écosystèmes marins et de leur fonctionnement dans un contexte de changement global. Une meilleure connaissance nécessite un effort à long terme de construction de bases de données ouvertes et accessibles à tous permettant de réaliser des méta-analyses sur la biodiversité marine.

Abstract :

     Our knowledge of marine biodiversity is incomplete. It is limited by the size and depth of the oceans, which cover 70% of the Earth's surface, and by the difficulty of deploying exploration and sampling resources across all environments. New metagenomic methods should allow for a significant breakthrough in knowledge, particularly regarding the diversity of planktonic microorganisms and the microbial and viral flora, estimated at millions of species. The ease of DNA analysis is leading to the discovery of extraordinary genetic richness in water and sediment samples, suggesting that these techniques will reveal many more species than those currently described. However, the confusion between cryptic diversity and species is misleading; in most cases, these taxa have not been and never have been described as species. This cryptic diversity indicates genetic diversity, an intraspecific component of biodiversity, as described for Foraminifera. It therefore remains essential to characterize the biology and ecology of organisms to allow for their formal description as species and their role in ecosystems. Recent structured databases are enabling advances in our understanding of marine ecosystems and their functioning in a context of global change. A better understanding requires a long-term effort to build open and accessible databases that will allow for meta-analyses on marine biodiversity.